罰則之附論

(一)禁止事業主對檢舉人員為不利處分

(第39-1條)

1.事業或污水下水道系統

不得因廢（污）水處理專責人員或其他受僱人，向主管機關或司法機關揭露違反本法之行為、擔任訴訟程序之證人或拒絕參與違反本法之行為，而予解僱、降調、減薪或其他不利之處分。

2.事業或污水下水道系統或其行使管理權之人

為1.規定所為之解僱、降調、減薪或其他不利之處分者，無效。

3.事業或污水下水道系統之廢（污）水處理

專責人員或其他受僱人，因1.規定之行為受有不利處分者，事業或污水下水道系統對於該不利處分與1.規定行為無關之事實，負舉證責任。

4.廢（污）水處理專責人員

或其他受僱人曾參與依本法應負刑事責任之行為，而向主管機關揭露或司法機關自白或自首，因而查獲其他正犯或共犯者，減輕或免除其刑。

(二)本法所定屆期仍未補正或完成改善之按次處罰

其限期改善或補正之期限、改善完成認定查驗方式、法令執行方式及其他應遵行事項之準則，由中央主管機關定之。(第57條)

(三)同一事業設置數放流口

或數事業共同設置廢水處理設施或使用同一放流口，其排放廢水未符合放流水標準或本法其他規定者，應分別處罰。(第58條)

(四)廢(污)水處理設施發生故障時

符合下列規定者，於故障發生二十四小時內，得不適用主管機關所定標準：(第59條)

1.立即修復或啟用備份裝置

並採行包括減少、停止生產或服務作業量或其他措施之應變措施。