自然保護區域

臺灣地區以自然保育為目的所劃設之保護區，可區分為自然保留區、野生動物保護區及野生動物重要棲息環境、國家公園及國家自然公園、自然保護區等四類型。分述如下：

一、自然保留區（22處）

1.農委會於75年6月27日起，依文化資產保存法先後指定公告了淡水河紅樹林、關渡、坪林臺灣油杉、哈盆、插天山、鴛鴦湖、南澳闊葉樹林、苗栗三義火炎山、澎湖玄武岩、阿里山臺灣一葉蘭、出雲山、台東紅葉村台東蘇鐵、高雄烏山頂泥火山、大武山、大武事業區臺灣穗花杉、挖子尾、烏石鼻海岸、墾丁高位珊瑚礁、九九峰等19處自然保留區，並指定管理機關管理，以維護及管理臺灣具有代表性的生態體系、或具有獨特地形地質意義、或具有基因保存永久觀察、教育研究價值之區域。

2.澎湖縣政府及屏東縣政府亦分別依法指定「澎湖南海玄武岩自然保留區」及「旭海-觀音鼻自然保留區」。

3.民國102年12月26日，臺北市劃設「北投石自然保留區」，為全國第22個自然保留區。「北投石」是全球唯一以臺灣地名命名的礦石，臺北市政府為保育珍貴的北投石，創全國之先。

4.臺灣地區於民國81年時，由國家科學委員會贊助研究經費，成立第一個長期生態學研究站（Long-term Ecological Research, LTER），名為「福山森林生態系」，包括哈盆自然保留區在內。

二、野生動物保護區（20處）及野生動物重要棲息環境（37處）

為保護野生動物及其棲息環境，我國自民國78年頒佈野生動物保育法後，即積極推動各項有關野生動物保育工作及野生動物保護區之設立，並自80年起，依野生動物保育法規定，由農委會核定、各縣市政府公告，先後公告劃設了澎湖縣貓嶼海鳥、高雄縣三民鄉楠梓仙溪魚類、宜蘭縣無尾港水鳥、臺北市野雁、台南市四草、澎湖縣望安島綠蠵龜、大肚溪口、棉花嶼及花瓶嶼海鳥、宜蘭縣蘭陽溪口水鳥、武陵櫻花鉤吻鮭、台東縣海端鄉新武呂溪魚類、馬祖列島燕鷗、玉里、新竹市濱海、台南縣曾文溪口黑面琵鷺、宜蘭縣雙連埤、台中縣高美、桃園高榮、翡翠水庫食蛇龜、桃園觀新藻礁生態系等20處野生動物保護區及棉花嶼、花瓶嶼、台中武陵櫻花鉤吻鮭、宜蘭縣蘭陽溪口、澎湖縣貓嶼、臺北市中興橋永福橋、高雄縣三民鄉楠梓仙溪、大肚溪口、宜蘭縣無尾港、台東縣海端鄉新武呂溪魚類、馬祖八島、玉里、棲蘭、丹大、關山、觀音海岸、觀霧寬尾鳳蝶、雪山坑溪、瑞岩溪、鹿林山、浸水營、茶茶牙賴山、雙鬼湖、台東利嘉、海岸山脈、水璉、塔山、客雅溪口及香山溼地、台南縣曾文溪口北岸黑面琵鷺、宜蘭縣雙連埤、台中縣高美、臺南市四草、雲林湖本八色鳥、嘉義縣鰲鼓、桃園高榮、翡翠水庫食蛇龜、桃園觀新藻礁生態系等37處野生動物重要棲息環境。由農委會、林務局及各主管縣市政府逐年編列經費，並與相關學術研究機構、地方保育團體合作推動保護區管理維護、調查研究、及教育宣導等工作。

三、國家公園（9處）及國家自然公園（1處）

自1872年美國設立世界上第一座國家公園－黃石國家公園迄今，世界上已有約一百個國家或地區設立了近千座國家公園。臺灣地區自民國70年起開始推動國家公園與自然保育工作，迄今由內政部依據「國家公園法」之規定已相繼成立了墾丁、玉山、陽明山、太魯閣、雪霸、金門、東沙環礁、臺江與澎湖南方四島共計9座國家公園及壽山國家自然公園。國家公園不同於都市公園、遊樂園，它的設立係保護國家特有之自然風景、野生動植物及人文史蹟，並提供國民育樂及研究，依國家公園法規定，國家公園得按區域內現有土地利用型態及資料特性，劃分為：一般管制區、遊憩區、史蹟保存區、特別景觀區、生態保護區。九座國家公園中，各具不同特色的自然景觀，嚴格限制開發行為。壽山國家自然公園於100年12月6日正式開園，此為第一座由下而上，經由地方民間保育團體發起推動而成立的國家自然公園。

四、自然保護區（6處）

農委會林務局為保護涵蓋國有森林內各種不同代表性生態體系及稀有動植物，依森林法經營管理國有林之需要，設立國有林自然保護區，後來各保護區經重新檢討定位後，其中大部分業由農委會依文化資產保存法或野生動物保育法先後指定公告為自然保留區、野生動物保護區或野生動物重要棲息環境。目前僅有雪霸、甲仙四德化石、十八羅漢山、海岸山脈台東蘇鐵、關山臺灣海棗、大武臺灣油杉等6處自然保護區。